五甲漁港現屬第二類漁港，港區南面邊界由南防波堤與防潮海堤之地籍界線交界點的南面點，沿南防波堤置堤頭；北面邊界由北防波堤與防潮海堤之地籍界線交界點的東北面之外端點，沿北防波堤往西延伸至堤頭外56公尺處；東面邊界以地號雜282之東面地線為界；西面邊界由南防波堤堤頭連接至北面邊界之西側端點。